elexiko kooperiert innerhalb des IDS mit dem Programmbereich Forschungsinfrastrukturen, dem Programmbereich Korpuslinguistik, den Zentralen DV-Diensten des IDS, dem Archiv für Gesprochenes Deutsch (Abteilung Pragmatik), dem Projekt Texttechnologie und Datenbanken (Abteilung Grammatik) und dem Projekt Grammis (Abteilung Grammatik). Außerdem ist elexiko am Online-Wortschatz-Informationssystem OWID beteiligt und arbeitet nicht zuletzt eng mit dem Projekt Benutzeradaptive Zugänge und Vernetzungen in elexiko zusammen.

Das Projekt elexiko pflegt kollegiale Kontakte innerhalb des Wissenschaftlichen Netzwerks „Internetlexikografie“, daneben besteht fachlicher Austausch mit dem Oxford English Dictionary (Oxford University Press), der Dudenredaktion Mannheim und der Canoo Technology AG (Basel). Darüber hinaus besteht im Zusammenhang mit lexikologischen Forschungsfragen Austausch mit der Universität Reading (UK), und im Rahmen kontrastiver empirischer Studien bestehen enge Kooperationen mit der Universität Manchester (UK) und der University of Sussex (UK). Das Projekt beteiligt sich außerdem mit der Erarbeitung von Lehreinheiten, der Betreuung für Studierende und der Durchführung von Lehrveranstaltungen am EMLex, dem European Master of Lexicography.